##
compile: \
Homolog_Model.o \
scr.o \
ali.o \
sub.o \
ali_tem.o \
ali_sub.o \
ali_def.o \
sub_bse.o \
sub_bbpck.o \
sub_usc.o \
sub_gen.o \
sub_grp.o \
sub_scpck.o
##
Homolog_Model.o: Homolog_Model.cc
	g++ -O3 -c Homolog_Model.cc
##
scr.o: scr.cc
	g++ -O3 -c scr.cc
ali.o: ali.cc
	g++ -O3 -c ali.cc
sub.o: sub.cc
	g++ -O3 -c sub.cc
##
ali_tem.o: ali_tem.cc
	g++ -O3 -c ali_tem.cc
ali_sub.o: ali_sub.cc
	g++ -O3 -c ali_sub.cc
ali_def.o: ali_def.cc
	g++ -O3 -c ali_def.cc
sub_bse.o: sub_bse.cc
	g++ -O3 -c sub_bse.cc
sub_bbpck.o: sub_bbpck.cc
	g++ -O3 -c sub_bbpck.cc
sub_usc.o: sub_usc.cc
	g++ -O3 -c sub_usc.cc
sub_gen.o: sub_gen.cc
	g++ -O3 -c sub_gen.cc
sub_grp.o: sub_grp.cc
	g++ -O3 -c sub_grp.cc
sub_scpck.o: sub_scpck.cc
	g++ -O3 -c sub_scpck.cc
##
clean:
	rm \
Homolog_Model.o \
scr.o \
ali.o \
sub.o \
ali_tem.o \
ali_sub.o \
ali_def.o \
sub_bse.o \
sub_bbpck.o \
sub_usc.o \
sub_gen.o \
sub_grp.o \
sub_scpck.o
##
